ნინო მახაშვილმა დაამთავრა თბილისის სახელმწიფო სამედიცინო ინსტიტუტი და თბილისის ფსიქიატრიის ინსტიტუტი, შემდეგ კი საზოგადოებრივი ჯანდაცვის დოქტორის წოდება მოიპოვა ილიას სახელმწიფო უნივერსიტეტში.
ილიას სახელმწიფო უნივერსიტეტში ხელმძღვანელობს ფსიქიკური ჯანმრთელობის ცენტრს და არის შესაბამისი სამაგისტრო პროგრამის თანადამფუძნებელი. პარალელურად, ფონდ „გლობალური ინიციატივა ფსიქიატრიაში – თბილისის” დირექტორია და მუშაობს ფსიქიკური ჯანმრთელობის სისტემის სტრუქტურულ გარდაქმნებზე კავკასიის, ცენტრალური აზიის და სხვა ქვეყნებში. წლების განმავლობაში ჯანმრთელობის მსოფლიო ორგანიზაციის ევროპის ოფისის უფროსი ექსპერტია, ევროპის საბჭოს ექსპერტი და მსოფლიო ფსიქიატრთა ასოციაციის საპატიო წევრი.
მისი კვლევითი და კლინიკური საქმიანობა ფოკუსირებულია სათემო ფსიქიატრიაზე, ფსიქოტრავმატოლოგიაზე და კატასტროფული მოვლენების შემდგომ ფსიქოსოციალურ რეაგირებაზე, განსაკუთრებით მოწყვლადი ჯგუფების — დევნილების, პატიმრებისა და ძალადობის მსხვერპლთა — მხარდაჭერაზე.